कश्मीर फाइल्स 32 साल पहले हुए कश्मीर पंडितों के वास्तविक जीवन के पलायन और नरसंहार पर आधारित है। साजिश जेएनयू के एक छात्र दर्शन कुमार के इर्द-गिर्द घूमती है, जिसे अपने बचपन के बारे में कुछ भी याद नहीं है। कई फिल्म निर्माताओं ने हमें कश्मीरी पंडितों के पलायन की कहानी बताने की कोशिश की है, लेकिन उनमें से कोई भी विवेक अग्निहोत्री की तरह सटीक और करीबी नहीं है। विधु विनोद चोपड़ा के विपरीत - जो खुद एक कश्मीरी, शिकारा हैं, अग्निहोत्री को क्रूर लेकिन ईमानदार आंत-विचित्र कहानी दिखाने में कोई गुरेज नहीं है।
2-घंटे-50-मिनट की लंबी फिल्म जनवरी 1990 की कड़ाके की ठंड में बच्चों के खेलने के साथ शुरू होती है। जबकि सचिन तेंदुलकर के क्रिकेट के बारे में कमेंट्री रेडियो पर चलती रहती है, कुछ कश्मीरी मुस्लिम लड़कों ने शिव नामक एक हिंदू युवा लड़के को मारा ( पृथ्वीराज सरनाइक) ने उनसे 'पाकिस्तान जिंदाबाद' के नारे लगाने को कहा। उसे पिटता देख उसका अच्छा दोस्त अब्दुल उसका हाथ पकड़ लेता है और उसे वहां से भागकर छिपने को कहता है। लेकिन इसके तुरंत बाद, हम देखते हैं कि कश्मीरी मुस्लिम युवाओं की एक विशाल रैली ने पंडितों के घरों में आग लगा दी और उनसे रालिव से पूछा, गालिव या त्चलिव का अर्थ है या तो इस्लाम में परिवर्तित हो जाओ, मर जाओ या कश्मीर छोड़ दो। 32 साल के पलायन के बाद भी, कोई भी अपनी मातृभूमि को नहीं भूला है और अपने वतन लौटने की एक अटूट आशा रखता है। काश मैं आपको और बता पाता, लेकिन मुझे लगता है कि दुनिया के सभी शब्द दर्द का वर्णन करने के लिए पर्याप्त नहीं हैं।